En 1835 al asumir como Jefe de Estado, para terminar el período de José Rafael Gallegos quien había renunciado, eliminó la Ley de la Ambulancia consolidando a San José como capital del país, separó a Costa Rica de la Federación centroamericana e impulsó la primera codificación nacional que se reconoce con su nombre, Código General de Carrillo.
Un día como hoy, 26 de junio de 1838, el Congreso le reconoce como Jefe de Estado, luego que fuera depuesto Manuel Aguilar Chacón.