El proceso de la conquista iniciaba en ese momento, aunque la penetración del territorio se llevara a cabo hasta 1519. En 1650 los conquistadores y colonizadores ya establecidos, principalmente en Cartago, ejercían control de tierras en la región del Atlántico y de Matina, donde habían desarrollado explotaciones cacaoteras y habían traído mano de obra negra, en condición de esclavos para trabajarlas. Piratas asolaban las tierras litorales de Centroamérica con la finalidad de saquear sus riquezas, robarse mano de obra y productos. Así un día como hoy, 28 de junio de 1681, piratas invaden el Valle de Matina, saqueándolo y tomando prisioneros; siendo rechazados por el Gobernador de Cartago, Juan Francisco Sáenz Vázquez.