En 1946 realizó su Primer Congreso donde se impulsó la Facultad de Humanidades. Bajo el rectorado de Rodrigo Facio Brenes se inició la Ciudad Universitaria y un día como hoy, 30 de abril de 1955, la Asamblea Universitaria, acuerda impulsar la Facultad de Ciencias y Letras, y la reforma universitaria que hace surgir gran cantidad de Facultades, Escuelas y Departamentos, y crea las bases para que el Consejo Estudiantil se transforme en 1958 en Federación de Estudiantes.