Ascendió a la presidencia por el golpe militar que dieron los militares Máximo Blanco y Lorenzo Salazar contra el Presidente Juan Rafael Mora Porras, y con ellos se involucró en el asesinato de los Héroes de la Campaña Nacional Mora y el General Jose María Cañas.
Fue casado en primeras nupcias con una hermana del Presidente Juan Rafael Mora Porras. Falleció en California y sus restos fueron expatriados en 1978.
José María Montealegre Fernández, ejerció la Presidencia de la República de manera provisional desde el 14 de agosto de 1859 al 29 de abril de 1860, un día como hoy, en que la asumió constitucionalmente hasta el 8 de mayo de 1863.
